地方政府管理者的决策缺乏科学的评估和论证，表现为追求短期的效益，重建设，轻规划；重投资，轻管理等。政府运作的成本意识淡薄，缺乏降低成本的激励机制，尤其是管理效率低下。部分干部在职务消费上超出预计成本，必然会挤占公共管理支出，无形之中增大了政府的管理成本。
3.组织结构存在危机
地方政府“计划”色彩较为浓厚，市场化进程较为缓慢，使得以行政为中心的高度“计划化”行政组织结构特点突出，而且越是贫困地区越是更加明显。政府组织机构庞大臃肿、冗员超编等状况严重，尽管中央自上而下的推行了机构改革，但组织结构的多样化存在，盘根错节的人情关系网，狭窄的人才就业和人员分流渠道，仍是诸多地方政府组织机构变革和公共管理职能转变的重重阻力。许多县乡政府自身的财政汲取能力无力支持政府正常运转，即使是中央财政和各部门财政下拨的转移支付和各项专项转移支付，被捆绑挪用作发放工资或者其他非生产性建设项目的情况较为严重。
4.行政效能低下
长期以来，我国农村公共管理采取自上而下的投资决策，不少领导认为谋发展就是直接办企业，有的不计成本招商引资，不顾条件上项目。这些做法造成了严重后果，有的亏损倒闭，形成乡镇政府巨额债务，有的污染严重，生态环境遭到破坏，再加上自然条件等众多制约因素，使得地方政府过度依赖于行政手段计划配置资源、加速经济的发展、干预企业生产、农民经营的状况仍比较普遍。致使经济发展水平层次低下，生态环境明显恶化。再加上政府决策者水平不高、办事效率低下、公共服务职能弱化、危机管理能力缺乏、行政创新动力不足，直接加剧了政府的行政效能危机。
5.公共信用和道德危机
公共信用危机，首先集中体现在地方政府的一些官员，为了加速地区经济发展，不切实际地大举借贷，盲目搞开发和建设，使政府背上了沉重的经济负担。政府公共管理中大量存在公共管理方式的简单化，公共服务的贫乏化，公共管理者的腐败，公共管理道德的迷失，直接加剧了政府的公共信用危机。
二、新农村建设中如何强化公共管理
1.财政支农资金全部纳入政府采购范围
政府采购是加强公共管理的一个重要手段，新农村建设中通过建立政府采购制度可以确保支农资金的预算按照规定用途使用。
2006年，中央财政和国债资金安排用于“三农”的投入将达到3，288亿元，比2005年增加333亿元，占2006年中央财政总支出增量1972亿元的1\/6多。若有超收，还要增加对“三农”的投入。如果按照国际公认的10%的政府采购平均节约率计算，实行政府采购后，一年就能节约财政支农资金300多亿元。所以，建立并不断完善政府采购制度，尽快将财政支农资金的分配使用全部纳入政府采购范围，严格按照法律法规进行规范的集中采购，让政府采购的阳光洒向农村，让广大农民得到实实在在的好处，是当前建设社会主义新农村的一项十分紧迫的任务。
（1）财政支农资金项目要列入集中采购目录。目前，大量的财政支农资金游离于政府采购之外，其中一个重要原因，就是支农资金支出项目未列入政府集中采购目录。因此，对新农村建设项目实行目录管理是实施政府采购的基础和前提。
（2）充分发挥政府集中采购机构的作用。政府集中采购是对传统采购方式的重大改变，有利于充分实现采购规模效益，降低采购成本，规范采购行为，并且便于进行监督。政府设立的集中采购机构是非营利事业法人，主要任务是负责政府集中采购目录内项目采购的组织实施工作。凡使用公共财政资金采购纳入政府集中采购目录中的支农项目，都要依法委托各级政府集中采购机构统一采购，不允许以项目特殊或实行部门集中采购为名，自行采购或委托社会中介机构代理采购。对此，要积极转变观念，调整工作思路和工作方法，尽快适应新的采购方式。