公元1409年（明成祖永乐七年） 为纪念释迦牟尼，宗喀巴在拉萨大昭寺发起了万人祈愿大会，标志着藏传佛教格鲁派创立。
公元1414年（永乐十二年） 永乐皇帝召请宗喀巴进京，宗喀巴应召派弟子释迦也失进京朝觐。
公元1578年（明神宗万历六年） 索南嘉措（三世达赖喇嘛）经今青海玉树州、果洛州到今青海海南藏族自治州所在地恰卜恰，与俺答汗相会。5月，在恰卜恰10万人集会上论经说法。
公元1616年（万历四十四年） 努尔哈赤在今辽宁新宾称汗，国号金，史称后金。
公元1638年（明思宗崇祯十一年，清太宗崇德三年） 皇太极派车辰等人出使西藏，开始同西藏地方势力建立联系。
公元1640年（崇德五年） 固始汗从青海发兵进藏，1641年向藏巴汗发动进攻。1642年藏巴汗投降，因谋杀固始汗的密谋败露，便将藏巴汗用湿牛皮裹捆起来后投入柳吾溪附近的河里处死。为建立具有蒙藏联盟性质的噶丹颇章西藏地方政权创造了条件。
公元1642年（崇德七年） 五世达赖和固始汗派遣的以伊拉古克三呼图克图为首的使团抵达盛京（沈阳），受到皇太极极高规格的接待。伊拉古克三呼图克图返藏时，皇太极分别致书五世达赖喇嘛、四世班禅、噶玛法王、萨迦法王、固始汗等人。
公元1644年（清世祖顺治元年）3月，李自成领导的明末农民起义军攻克北京，推翻了明王朝统治。月余后清军攻陷北京，李自成败逃。
公元1653年（顺治十年）1月14日，五世达赖在北京南苑谒见顺治皇帝。
5月，顺治帝派礼部尚书觉罗郎球等人，持刻有满汉藏三种文字的金册、金印，赴蒙古代噶为返藏途中的五世达赖喇嘛举行了隆重的授封仪式，正式封五世达赖喇嘛为“西天大善自在佛所领天下释教普通瓦赤喇怛喇达赖喇嘛”，标志达赖喇嘛封号及其在西藏的宗教领袖地位正式被清朝中央政府确认。
公元1696年（清圣祖康熙三十五年） 康熙皇帝亲率大军征讨噶尔丹。
公元1713年（康熙五十二年）2月24，日康熙帝颁诏册封五世班禅罗桑益西为“班禅额尔德尼”，赐满汉藏三种文字的金册、金印。从此，班禅的宗教领袖地位得到清朝中央政府的进一步确认，历代班禅受中央政府册封遂成定制。