坚决抵制。但在中央政府的优势兵力面前，刘湘最终屈服，同意将所有军队都转归国民政府军委会直接指挥，川军的财政开支转归蒋的重庆行营负责，一切军事设施也由国民政府接管。同时蒋决定召开整军会议改编川军。
7月初，川康整军会议由何应钦主持在重庆召开。矛头主要是指向刘湘，对其他军阀（二十军杨森、二十四军刘文辉、二十八军邓锡侯、二十九军孙震及四川边防军李家钰）是能吃则吃，能削则削。当时刘湘是省主席兼四川善后督办（后改为川康绥靖主任），各派军阀对他独揽大权都十分不满，但慑于刘湘的实力，表面不得不唯唯诺诺以示遵从，而思想深处则有强烈的反感。蒋介石就利用这一点，纵横捭阖，终于使会议通过了有关川军的三项决议：各军缩减1／5；团长以上军官由中央直接委派；军饷每月由军政部派员点名发放。至此，川军的人事权和财政权都被收归中央统一掌管。
这一阶段，刘湘对蒋介石还是比较强硬的，刘湘说过这样的话：“我如果要干的话（指川军要反蒋）就是天也要打它一个洞。”不过，刘湘终于没有行动，在民族危机加重的关头，一切以民族大义为重，任何私怨都可以也应该捐弃。
1937年8月7日，刘湘赴南京参加蒋介石召开的最高国防会议，在会上竭力主战，提出“抗战四川可以出兵30万，提供壮丁500万，供给粮食若干万石”。刘湘慷慨激昂的发言得到全场的赞许，高涨的民族主义终于开始驱散拥兵割据等落后观念。9月1日，川军分东、北两路开始出川抗日。