统一六国后，商鞅变法时极力反对的各方面的学派、人才都成为了为秦朝服务，而可能因为秦始皇采用了“秦国特色的商鞅变法”，造成秦帝国各种迷信盛行。其中黄老道家、阴阳家，他们综合儒、法、道诸家的学说，提出所谓“五德终始说”，尤其得到始皇的信任，始皇接受五德之说，认为秦是水德，周是火德，水能克火，因此秦得天下；而从齐燕来的儒生方士们把儒家的“封禅”也作了改头换面的修改，自此成为自古帝王莫不举行的封禅典礼。
同时他们又说海上有蓬莱、方丈、瀛洲三岛，是神仙居住的地方，有“不死之药”，服后便可“长生不老”；嬴政自然对此极度动心，在秦始皇二十八年，他派遣齐人徐福等征发童男女数千人入海访求仙人（传闻中这些人最后东渡日本列岛、建立了日本国）。而他本人则在二十八年至三十一年连续到东方沿海，江淮流域以及北边等地巡游，所到之处，无不刻石颂其功德。
三十二年始皇又使燕人卢生求羡门、高誓等仙人踪迹，后来又使韩佟、侯公、石生求仙人不死之药；对于他这种行为，也有儒生表示劝谏的，像博士齐人淳于越便建议始皇仍实行分封自己的子弟为诸侯的政策。嬴政将此事交给臣下讨论，丞相李斯便明确反对，而李斯的奏议则促成了秦始皇帝下令焚书禁书，规定史书非秦纪皆烧之的行动。具体如下：非博士官所职，天下敢有藏《诗》、《书》、百家《论》者，悉诣守、尉杂烧之；有敢偶语《诗》、《书》者，弃市；以古非今者，灭族！吏见知不举者与同罪；令下三十日不烧，黥为城旦；准保存者，只有医药卜筮种树之书。若愿学法令，则以吏为师。这一政策实在是令后世无数学者扼腕太息。
而徐福一直没能带回灵药，令始皇心中感到受骗，命令御史案问诸生，诸生互相揭发牵连达四百六十余人，大怒的嬴政下令把他们都在咸阳活埋，这就是著名的“坑儒”，，今天的我们已经无法确定当日的这一“坑”，到底坑掉了多少高明的智慧和传承，千载悠悠下，唯余一声久久的感慨——可惜啊..
********统一七年之后，秦始皇开始在渭河南岸修建后世皆知的阿房宫，每年也动用民工达七十多万人，当时全国总人口不过2000万，可知这项工程已经是国家工程级别。建成之后的阿房宫可以容纳十万人，在里面运送酒菜要用车和马才行，仅一个前殿的面积就达到了东西长693米，南北宽116米，台基高达11。65米，上面可以同时坐上万人。但后世的阿房宫考古队，对阿房宫遗址进行的考古工作发现，阿房宫本来就没有建成，秦朝时这座宫殿仅仅完成了地基而已。
秦始皇三十七年（公元前210年），秦始皇死于他第五次东巡途中，传说的死因有很多很多，但本文中咱们取病死这一猜测。在他死后，赵高采取了说服胡亥威胁李斯的手法，二人经过一番密谋，假造秦始皇发布诏书，由胡亥继承皇位。同时，还以秦始皇的名义指责扶苏为子不孝、蒙恬为臣不忠，让他们自杀，不得违抗。在得到扶苏自杀的确切消息后，胡亥、赵高、李斯这才命令车队日夜兼程，迅速返回咸阳。
为了继续欺骗臣民，车队不敢捷径回咸阳，而是摆出继续出巡的架势，绕道回到咸阳；暑天高温，秦始皇的尸体很快腐烂发臭，但为了遮人耳目，胡亥命人买了许多鲍鱼装在车上，鲍鱼的浓烈味道掩盖了尸体的腐臭味，迷惑了众人。到达咸阳后，胡亥继位秦地，便是秦二世，而赵高则任郎中令，李斯依旧做丞相，朝廷的大权实际上落到了赵高手中。
赵高计谋得逞以后，开始对身边的人下手；他先是布下陷阱，把李斯逐步逼上死路，李斯发觉赵高阴谋后，就上书二世告发赵高，而胡亥自然偏袒赵高，将李斯治罪，最后将李斯腰斩于咸阳，这位在秦朝建立中立下了真正汗马功劳的丞相和蒙恬一样惨死于宫廷斗争。随后赵高便升任丞相，加上他可以出入宫禁，后称“中丞相”。
年秦二世胡亥即位之后，进一步加重了对普通农民的剥削和压迫，以“税民深者为明吏”，以“杀人众者为忠臣”。他颁令农民增交菽粟刍藁，自备粮食，转输至咸阳，供官吏、军队以至于狗马****的需要；进而继续修建阿房宫，继续发民远戍。随着徭役征发的对象进一步扩大，农民的困苦可说达于极点，大规模的农民起义已经到一触即发的地步。
就在在普通农民们酝酿反秦的时候，潜伏着的六国旧贵族残余势力也在俟机进行分裂活动。在秦始皇三十六年（公元前211年），东郡出现“始皇帝死而地分”的刻辞，就是这种分裂活动的征兆。
重压之下，秦朝表面平静的统治下，暗涛汹涌已达极致，就在秦二世元年（公元前209年）七月，一队开赴渔阳的闾左戍卒九百人，因为遇大雨被迫停留在大泽乡一带，没能如期赶到渔阳戍地；秦法规定“失期当斩”，戍卒们面临着死刑的威胁。
结果，在陈胜、吴广的领导下，大泽乡中举起了中国历史上第一次大规模农民起义的旗帜；陈胜，吴广杀死押送他们的秦尉，率领戍卒，用已被赐死的秦公子扶苏和已故楚